Histórico de Marzo, 2007

DESARROLLO DE VECTORES LENTIVIRALES MÁS SEGUROS Y EFICIENTES: Aplicaciones en terapia génica del Síndrome de Wiskott-Aldrich.

Martes, Marzo 27th, 2007, por master_inmunologia@ugr.es

Por Marién Cobo.

La terapia génica es una alternativa muy interesante ya que existen muchas enfermedades incurables con los métodos existentes. Pero este tipo de terapia tiene un éxito limitado aun, ya que existen todavía muchos aspectos en cuanto a seguridad biológica y eficiencia, que hay que mejorar para su aplicación en clínica.Todo esto persigue la producción de expresión de un gen o genes que se hayan alterados en una patología concreta, para o bien restaurar la expresión normal de un gen mutado o bien para expresar gen/es terapéutico/s que impidan la progresión de la enfermedad. Para ello se introduce el gen terapéutico (transgen) dentro de un vector viral, el cual ha sido manipulado para la integración del transgen en el genoma de la célula diana eliminado aquellos genes virales que puedan comprometer la seguridad biológica del sistema viral usado.

De todos los tipos de vectores virales, los lentivirales basados en el HIV-1, poseen una eficiencia y seguridad biológica mejor que el resto, pero aun así presentan problemas que hay que eliminar para poder ser usados terapéuticamente. Otro problema existente es la expresión ectópica del transgen, la cual podría producir efectos tóxicos. Por ello un punto importante a estudiar es la introducción en el vector de un promotor tejido específico.

El Síndrome de Wiskott-Aldrich (WAS) es una inmunodeficiencia primaria ligada al cromosoma X causada por mutaciones en el gen was el cual codifica para la proteína WASp, involucrada en la integración de señales extracelulares con reordenación del citoesqueleto de actina. La expresión de WASp es exclusiva de tejido hematopoyético, por ello en nuestro modelo usamos el promotor proximal de was.

Actualmente existen tratamientos paliativos de la enfermedad, como la administración de antibióticos y de inmunoglobulinas, transfusión de plaquetas para evitar hemorragias, o la extirpación del bazo, lo que conlleva un aumento en las infecciones. Otro procedimiento sería el transplante de médula ósea de donante HLA idéntico dentro d e los primeros 5 años de vida del paciente, con las complicaciones que ello conlleva, por ello la terapia génica es una estrategia terapéutica en proceso de estudio.

La terapia génica de WAS requiere la transducción de células hematopoyéticas pluripotenciales (HSCs), obtenidas por selección positiva de CD34+, las cuales serán transducidas con los diferentes vectores modelo creados por nuestro grupo, para intentar desarrollar células productoras estables de la proteína WASp.

En mi grupo de investigación buscamos mejorar estos vectores mediante:

* Desarrollo de un vector con sistema de seguridad activa (VSSA), el cual permita la expresión del gen terapéutico y la destrucción inducibles de estas células si apareciesen efectos secundarios indeseables.
* Construcción de vectores lentivirales específicos de tejido hematopoyético para la expresión del transgen de manera estable y segura.
* Desarrollo de vectores de utilidad clínica para terapia génica del Síndrome de Wiskott-Aldrich.

 

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XML: Hablemos el mismo idioma

Lunes, Marzo 26th, 2007, por intelligenia

Mas Yahveh descendió para ver la ciudad y la torre que los hombres estaban levantando y dijo: «He aquí que todos forman un solo pueblo y todos hablan una misma lengua, siendo este el principio de sus empresas. Nada les impedirá que lleven a cabo todo lo que se propongan. Pues bien, descendamos y allí mismo confundamos su lenguaje de modo que no se entiendan los unos con los otros»

Génesis 11:1-9.

Recientemente se ha escrito en este blog sobre servicios web, lo que ha servido para dar unas pinceladas sobre lo que son y donde se ha mencionado XML como el estándar para intercambio de datos. Ahora bien, ¿qué es XML? y, sobre todo ¿qué relación guarda con la sanidad?.

XML es acrónimo del inglés eXtensible Markup Language, que se puede traducir libremente como "Lenguaje extensible de etiquetas". La idea fundamental es definir, más que un lenguaje, un conjunto de reglas que nos permitan definir cualquier lenguaje que necesitemos.

Quizás uno de los aspectos más interesantes de XML es que es inteligible, esto es, que a simple vista podemos comprender lo que significa. Un ejemplo es la mejor forma de, evitando los detalles técnicos, entender qué es XML:

<ListinTelefonico>

<Persona>

<Nombre>Antonio</Nombre>

<Apellidos>Morales García</Apellidos>

<Telefono>958292929</Telefono>

</Persona>

<Persona>

<Nombre>Maria</Nombre>

<Apellidos>Pérez Sánchez</Apellidos>

<Telefono>958333333&lt;/Telefono>

<Telefono>634981209</Telefono>

</Persona>

</ListinTelefonico>

Del mismo modo que hemos “escrito en XML” un listín telefónico, podríamos escribir cualquier información. Incluso podemos escribir información y relacionarla entre ella mediante enlaces. Por ejemplo podemos tener un fichero XML para describir pacientes y otro fichero distinto para describir pruebas médicas, enlazando uno con otro.

Sin duda uno de los aspectos más importantes de XML es la revolución que ha supuesto de cara a compartir la información entre distintos sistemas informáticos. Ahora cualquier aplicación cuenta con un sistema sencillo para comunicarse con el resto, y esto supone innumerables ventajas.

En el ámbito de la sanidad encontramos una gran cantidad de posibles aplicaciones de esta tecnología, de la filosofía de los servicios web, de la idea de compartir la información de la que se dispone para que otras aplicaciones puedan aprovecharla. Por ejemplo los historiales de los pacientes podrían estar disponibles para su consulta desde cualquier lugar: cada centro podría aportar los datos de los que dispone y cada aplicación (que será distinta según el hospital en que nos encontremos) tendría acceso a todos esos datos y compondría un historial mucho más completo que los que hasta ahora existen.

Para componer la historia clínica de una persona, esa misma aplicación podría acceder no solo a los sistemas informáticos hospitalarios (a nivel nacional o incluso internacional), sino también, por ejemplo, a los sistemas informáticos que soportan la receta electrónica, y de este modo conocer con precisión los tratamientos que ha seguido el paciente incluso cuando solo ha sido atendido en el centro de salud.

Los ejemplos anteriores ilustran ya las posibilidades que ofrece una herramienta tan potente como XML, pero combinando esta tecnología con técnicas avanzadas de minería de datos o con sistemas de ayuda a la decisión permitiría alcanzar unos resultados impresionantes. Así por ejemplo hospitales de todo el mundo podrían decidir publicar los historiales clínicos de los pacientes de modo anónimo, es decir, evitando dar datos que permitan identificar al paciente y aportando únicamente los datos con relevancia médica. En este caso, y sin ser preciso siquiera que todos los hospitales se pusiesen de acuerdo en qué información aportar y como aportarla, sino limitándose únicamente a utilizar XML, se generaría una base de datos enorme que podría ser explotada por terceros. En este contexto un hospital podría decidir elaborar una aplicación que se conectase a todos esos hospitales y, periódicamente, extrajese de ellos toda esa información. Luego un sistema experto sería capaz de utilizar dicha información para asistir a los médicos en el diagnóstico o un programa de minería de datos podría detectar una frecuencia inusualmente baja de una enfermedad concreta en los pacientes que han sido tratados con un determinado medicamento.

En definitiva, XML puede aportar, y está aportando, a la sanidad lo que ya ha aportado a otras muchas áreas que se soportan en la informática: interoperabilidad. Un nuevo modo de compartir la información y hacer que esté disponible desde cualquier lugar y en cualquier momento. Existen estándares sobre XML específicos para la sanidad. Así por ejemplo el XML-HL7 permite representar los historiales clínicos y se está usando ya en múltiples aplicaciones a nivel Internacional.

intelligenia

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EL PAPEL DE LAS CÉLULAS B EN ENFERMEDADES AUTOINMUNES

Domingo, Marzo 25th, 2007, por master_inmunologia@ugr.es
Las enfermedades autoinmunes se producen cuando el Sistema Inmune reconoce, como si fueran extraños, antígenos del propio organismo, y actúa contra ellos causando daño en los tejidos.Las enfermedades autoinmunes suelen ir asociadas a un componente genético (en muchos casos se relacionan con los genes del complejo mayor de histocompatibilidad), pero también juegan un papel importante los factores ambientales como son las infecciones, ciertos medicamentos y las hormonas. Las enfermedades autoinmunes son en general mucho más frecuentes en mujeres que en hombres, por lo que se cree que las hormonas sexuales femeninas juegan un papel importante en su desarrollo. Todos tenemos linfocitos T y B con potencialidad autorreactiva, pero existen una serie de mecanismos de auto-tolerancia que permiten su eliminación física o funcional, principalmente:- Eliminación de linfocitos T y B autorreactivos.- Inactivación funcional (anergia) o física (apoptosis) de los linfocitos. - Generación de células supresoras, llamadas células T reguladoras, que se encargan eliminar a los linfocitos T autorreactivos.Cuando fallan estos mecanismos se produce una enfermedad autoinmune. Las enfermedades autoinmunes pueden ser sistémicas u órgano-específicas. Entre las primeras se incluyen las que afectan a gran número de órganos: Lupus eritematoso sistémico, Artritis reumatoide, Esclerodermia, Esclerosis múltiple, Espondilitis anquilosante o Sindrome de Sjögren. En las enfermedades autoinmunes órgano-específicas la respuesta inmune se produce contra un órgano o tipo celular concreto: Diabetes mellitus dependiente de insulina, miastenia grave, tiroiditis de Hashimoto, Síndrome de Goodpasture,…. Es frecuente que una enfermedad autoinmune venga precedida de una infección. Los agentes infecciosos tienen capacidad de generar enfermedades autoinmunes mediante diferentes mecanismos: actuando como superantígenos,  modificando autoantígenos, infectando a las propias células T y alterando su función, generando una reacción cruzada por mimetismo molecular,… Recientemente se ha publicado la importancia de los mecanismos encargados de mantener la anergia de células B en la prevención de enfermedades autoinmunes (Gauld S.B, Merell K.T y Cambier J.C. Current Opinion in Immunology 2006, 18:292-297). El mantenimiento de la anergia requiere mecanismos de retroalimentación que inhiben la señal del receptor de las células B (BCR) y promueven la muerte celular, en los cuales están involucradas moléculas como Lyn, SHP-1 o SHIP-1.Si se interrumpen estas rutas de señalización puede perderse la anergia, propiciándose la autoinmunidad.Estudiando modelos de ratones transgénicos se ha visto que existen tres mecanismos distintos que mantienen la anergia de las células B autorreactivas: atenuación de la señal del BCR, reducción de la expresión de Inmunoglobulina M en membrana y reducción de la vida media de estas células.Por otro lado se ha comprobado que, para el mantenimiento de la anergia, es necesaria la unión continua de antígeno al BCR, lo cual sugiere que esta estimulación crónica del BCR promueve la actuación de circuitos de retroinhibición que mantienen la anergia y favorecen la muerte celular. Recientemente se ha descubierto una molécula llamada BAFF (Factor de Activación de Células B) que se relaciona con la aparición de enfermedades autoinmunes, aunque no se conoce con certeza el papel que juega en este proceso. Se cree que podría actuar como una molécula co-activadora, proporcionando una “segunda señal” que revertiría la anergia de las células B autorreactivas. También podría actuar revirtiendo la insensibilidad del BCR, o simplemente aumentando la vida de estas células, incrementando así la probabilidad de que participen en la respuesta inmune.Las células B autorreactivas no solo contribuyen a la autoinmunidad mediante la producción de auto-anticuerpos, también pueden participar actuando como células presentadoras de antígenos a las células T, como ocurre en la Diabetes de tipo I. Los conocimientos en este campo son limitados pero probablemente con el tiempo se llegará a comprender el porqué de estas enfermedades y se podrán aplicar estos conocimientos al desarrollo de nuevos tratamientos.  
 

EVA SÁNCHEZ TOMÉ

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El debate sobre la energía

Martes, Marzo 20th, 2007, por José Mariano Ruiz de Almodóvar Rivera

 

                                      fisicarecreativa2057.jpg    Entender, en sus justas dimensiones, los riesgos y los beneficios derivados del uso de las radiaciones ionizantes no es fácil.

         A lo largo del tiempo, y del recorrido de este blog, nos hemos ocupado con interés de la energía. El intercambio de opiniones ha sido activo y no nos ha sorprendido encontrar comentarios variopintos. Los post que encabezaban esos comentarios estaban dedicados al debate científico, y social, de las aplicaciones pacíficas de la energía nuclear. Los recientes comentarios que se han colocado tras nuestro último post, se refieren a un motor que es irreal y físicamente imposible. Se nos describía un extraordinario sistema que, según su inventor, es capaz de producir más energía que el trabajo que necesita para ponerse en movimiento. No creo que sea necesario abundar más en las razones contrarias a su validez científica que han sido expuestas con toda claridad Manolo Vilches. Manolo lleva razón: Ningún motor, lo dicen las leyes universales de la termodinámica, puede ser un  móvil perpetuo de segunda especie.

       Y dicho esto volvamos a nuestro tema: El último número de la revista Radiation Research (Marzo 2007) publica un conjunto de estudios sobre la evolución de la salud de las personas que en Chernobyl, hace 20 años, quedaron expuestas a los efectos de la contaminación radiactiva. Recordamos que algunas personas, participantes activas en la extinción del incendio de la central nuclear, sufrieron lesiones agudas, de tan extrema gravedad, que fallecieron a consecuencia de ellas. El seguimiento de los ciudadanos que sufrieron la irradiación ha demostrado que, entre los afectados se produce un incremento de la incidencia de cáncer que es estadísticamente significativo. El estudio publicado en Radiation Research nos aporta datos científicos que permiten la evaluación de las consecuencias del accidente y facilitan una aproximación al conocimiento de los riesgos.

       La utilización de la radiación con fines pacíficos produce enormes beneficios. También riesgos. Unos beneficios son  fáciles de entender y se llaman diagnóstico y terapéutica de las enfermedades. Otros revelan nuestra inseguridad y se llaman energía. Como sociedad hemos aceptado las aplicaciones médicas de la radiación y no se discuten los beneficios que de ellas derivan. Sin embargo las aplicaciones energéticas, y las posibles derivaciones de la tecnología nuclear al desarrollo de armas, dibujan un panorama incierto que es fuente inagotable de controversias.  Ahora (19-03-07) hemos leído en la prensa dos noticias: a) EE UU transferirá los fondos congelados a Corea como parte del acuerdo para su desarme nuclear, y 2) Una delegación rusa intenta vender hoy una central nuclear a Marruecos.

     Casi vale la pena volver al principio: entender los intereses de la ciudadanía mundial es difícil. Manejarlos imposible. Sólo vale hablar, explicar, exponer razones y convencer: ¿Es esto la política?.

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Internet: El conocimiento al alcance del pueblo

Viernes, Marzo 16th, 2007, por intelligenia

Que Internet ha supuesto un cambio en el mundo es algo que no es necesario decir. Es un cambio al que aún nos estamos acostumbrando, pues afecta a numerosas facetas de nuestra vida. Cada vez se piensa menos en el teléfono y más en el correo eletrónico o el messenger, nos acordamos menos del periódico y más de esa página en la que solemos mirar la cartelera, y para hacer un trabajo en el colegio los niños ya no recurren a una enciclopedia, sino a google y a la Wikipedia1.

¿Los niños? El otro día un profesor me comentaba lo sencillo que es hacer un doctorado en estos tiempos. Cuando yo lo hice -me decía- no teníamos Internet. Claro, antes los doctorandos tenían que averiguar que libros y revistas existían sobre el tema, conseguirlos -una tarea que a veces es muy complicada- leerlos enteros (el papel y la tinta no incorporan buscador), y al final, con un poco de suerte, extraer alguna información valiosa. Ahora todo ese trabajo se reduce a buscar un par de minutos en Internet: tienes a tu alcance, por supuesto, una ingente cantidad de revistas y publicaciones científicas y además puedes encontrar todos esos artículos que no encontraron lugar en ningún sitio y solo se publicaron en un blog o en una página personal.

Sin embargo hay ciertos casos y ciertas perspectivas en las que todo lo que Internet ofrece al mundo puede considerarse negativo. Un ejemplo de esto es precisamente la sanidad. Varios médicos de atención primaria y algún especialista (incluso el conocido Dr. House bromea con el tema en algún episodio de la serie) me han comentado en alguna ocasión como los pacientes llegan a sus consultas, tras haberse informado en Internet, buscando más una confirmación de su auto-diagnóstico que un diagnóstico en sí. Esto naturalmente siempre ha existido: "Doctor, esto va a ser lo mismo que le pasó a mi prima, porque tengo los mismos síntomas", pero por culpa de Internet ahora los pacientes cuentan con un nuevo apoyo para su convencimiento, un arma que esgrimir contra las razones que el médico pueda tener para no hacer esa prueba o no recetar ese tratamiento.

Hay que ver sin embargo las dos caras de la moneda. Y es que sin entrar en detalles médicos (que por cierto ignoro), conozco un caso de una enfermedad rara que no fue diagnosticada correctamente durante varios años. Tras inumerables diagnósticos erráticos y visitas a distintos médicos, gracias a Internet, fue el marido de la enferma el que encontró una enfermedad que encajaba en el cuadro clínico que presentaba la paciente y que era suficientemente infrecuente como para que no la hubiesen sabido diagnosticar. En este peculiar caso ni el esposo ni su familia daban ningún valor a un diagnóstico realizado de este modo, hasta el punto de que el simple hecho de planteárselo a los médicos les dio bastante reparo. Por suerte para la paciente habían acertado, y ahora, aunque continúa enferma, al menos sabe lo que tiene y recibe un tratamiento más adecuado.

El problema de poner tanta información al alcance de la gente es que es preciso primero aprender a manejar todo eso. Me han hablado de algunos institutos en los que la Wikipedia e Internet en general no se aceptan como fuentes de información técnica para la realización de trabajos. No, al menos, si no se contrasta dicha información con otras fuentes de mayor fiabilidad (al menos mayor fiabilidad supuesta) o con datos objetivos (estadísticas, demostraciones matemáticas, etc.). Quizás esta puede ser una primera forma de enseñar a la gente a relacionarse con una nueva realidad: la no existencia de fronteras para la información.

Una vez se entienda que Internet es solo un medio de comunicación y que por sí solo no garantiza la certeza de la información que por él se transmite, y que aceptemos que disponer de la información no nos capacita para entenderla, podremos sacar todo el provecho a esta red y dejar de temer consecuencias negativas.

intelligenia

1Wikipedia: Proyecto para escribir comunitariamente enciclopedias libres en todos los idiomas. La versión en Español se encuentra disponible en http://es.wikipedia.org

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La potencia sin control no sirve de nada

Lunes, Marzo 12th, 2007, por intelligenia

Esa famosa frase utilizada en el anuncio de un fabricante de ruedas de coche, define perfectamente muchas cosas de la vida cotidiana, pero más aun define el uso que se le da a la potencia de cómputo que tiene la humanidad y cómo se aprovecha dicha potencia.

Como escribe Jose Luis Bernier en el post "Su ordenador personal al servico de la ciencia y la medicina " son muchos los recursos que tiene la humanidad entre PCs, clusters, supercomputadores y demás aparatos capaces de procesar información, ya existe tecnología para intercomunicar toda esa potencia como son los sistemas Grids. La pregunta es ¿por qué no se aprovecha toda esa potencia? Estas cuestiones son las que se tratan en ese post, y se proponen algunas aplicaciones de investigación que se verían beneficiadas de toda esa potencia.

(more…)

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Investigación Biomédica y Literatura

Jueves, Marzo 8th, 2007, por José Mariano Ruiz de Almodóvar Rivera

biomedicina5.jpg

Mi anterior post: Apoptosis, necrosis, autofagia y literatura tenía un sabor final amargo.

Puede parecer que detrás de cada una de las citas literarias que allí incluía no quedaba nada, salvo tristeza.

La investigación en ciencias biomédicas es otra cosa: Detrás de la última frase, detrás de la última palabra de cada publicación, detrás de la última palabra de cada artículo científico importante queda casi todo por hacer y por decir. Esto es así porque en ciencia los saberes son resultado de las experiencias; y el progreso de la medicina, cada vez más compresivo, surge de experimentos que llevan al investigador desde la molécula hasta los seres vivos a través de organizaciones jerárquicas de macromoléculas, organelas, células, tejidos y órganos, de creciente complejidad. De ello, el conocimiento individual debe ser cambiante y progresivo. Las ciencias médicas son así una obra que no tiene solución de continuidad y cuya evolución ayuda a conseguir, y transmitir, el conocimiento y a tratar y cuidar las enfermedades. Por eso, a sabiendas de la enorme dificultad que es avanzar en ciencias biomédicas, este post lo quiero terminar con una cita literaria que evite la sensación de amargura:

Dice Luis García Montero

"Gloria a los sueños que vuelven a caminar aun que parezcan derrotados, gloria a las bellas ilusiones que saben hacerse humanas, para caerse, para volver a levantarse, para dar vueltas en el universo mezclando su destino con la tierra"

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